无痛人工流产会有流不干净的可能性，但一般情况下，无痛人工流产都可以彻底清除妊娠组织，所以不必过于担心。一般情况下，无痛人工流产流不干净的原因与子宫畸形、位置异常和操作者不熟练等有关，例如纵隔子宫，子宫在中间有一个纵隔，而术前如果没有详尽的辅助检查，可能只吸到一侧宫腔，而妊娠囊若着床在另一侧宫腔，则可能会造成宫腔残留。所以术前详细告知医师自身手术史及病情，有助于确保手术顺利进行。