卵巢囊肿是否严重，主要是依据囊肿的类型以及手术后的囊肿的病理情况而定。如果是生理性的卵巢囊肿，常见于月经规律的女性，在整个月经周期过程当中，卵巢会呈现出囊性样的改变。这种情况下月经干净以后，卵巢囊肿就会自然消失，无需过于担心，也不用特殊的处理。如果是病理性的卵巢囊肿，而且大小超过五公分以上，就需要进行手术治疗。同时在手术后对于卵巢囊肿进行病理的切片检查，如果病理检查发现是恶性，说明这个病情就比较严重，需要进一步做相关治疗。因此卵巢囊肿是否严重，还需要具体情况具体分析。