右侧卵巢囊肿一般不会影响怀孕。因为右侧卵巢囊肿大多数属于良性囊肿，如果囊肿比较小，一般不会影响卵巢内分泌功能，所以也不会影响正常怀孕。其次，右侧卵巢囊肿即使比较大，影响了卵巢内分泌功能，但是左侧卵巢功能正常，也不会影响正常怀孕。所以，女性发现有右侧卵巢囊肿，首先需要确诊囊肿性质，只要是良性囊肿，而且囊肿比较小暂时不需要处理，只需要遵医嘱定期复查，观察囊肿变化情况。只有在囊肿超过5厘米以上，需要手术治疗。