你好，一般来说是可以，因为农村合作医疗鼓励就近在乡镇医院治疗，如果确实是急诊或者在乡镇医院医疗条件不许可的情况下需要办理转院手续才可以按照正常比例报销，没有经过许可就在所属地市级医院治疗的，报销比例很低。农保和社保的报销是一样的：只要出具农保证，医院会按照报销比例和用药处方从医疗费用开支中自动扣除。