卵巢囊肿3cm不算严重。如果是生理性的囊肿，可能会自行消失，如果在生理期之前查的是卵巢囊肿3cm，一定要在生理期结束后再做一次检查，总的来说3cm不算大，所以卵巢囊肿3cm不算严重。但要观察一下有没有腹痛、流血等情况的发生，如果没有可以不用处理，但是要在后续生活中多留意多观察。