月经不调时同房并没有什么危害，但是如果没有做好备孕准备，性生活时要合理的使用安全套做好避孕措施，防止意外怀孕，同时还能够隔离细菌，避免性传播疾病。月经不调虽然不会影响同房，但是可能会影响到正常的月经周期，容易引起贫血、头晕、食欲减退、身体乏力等不适症状出现，对于身体还是有一定危害的。最好要针对病因，及时的采取相应的方法调理治疗。